HILFE-FÜR-JUNGS e.V. hat sich 1992 unter dem Vorläufer als subway e.V. gegründet. subway startete im Frühjahr 1994 mit der Straßensozialarbeit in der männlichen Sexarbeiter*szene. Am 1. 12. 1994 eröffnete die subway Anlaufstelle für Jungs*, die unterwegs sind und anschaffen. Seit 2002 unterhält es ein Arztmobil und einen Beratungsbus für die aufsuchende Arbeit. 2003 und 2004 führte subway eine umfangreiche Feldstudie mit Befragung von über 2.000 Jungen* in Berlin zu ihren Erfahrungen mit sexueller Ansprache und Gewalt durch. Seit 2006 besteht das Projekt berliner jungs zur Prävention und Beratung von Jungen*, die von sexueller Gewalt bedroht oder betroffen sind. Seit 2017 bietet das Projekt MUT Traumahilfe für Männer*, die im Zusammenhang mit sexueller Gewalt Belastungen erleben.
Im November 2009 hat der Verein seinen Namen geändert und heißt jetzt HILFE-FÜR-JUNGS e. V., die Vereinssatzung ist hier zu finden.